Micro-SPECT یا micro-Single Photon Emission Computed Tomography، تکنیک تصویربرداری دیگری است که از مولکول های نشاندار شده با مواد رادیواکتیو برای ردیابی فرآیندهای بیولوژیکی استفاده می کند. در این روش به حیوانات یک رادیودارو تزریق می شود که اشعه گاما ساطع می کند. اشعه گاما توسط یک اسکنر شناسایی می شود تا تصویری سه بعدی از بدن ایجاد شود. Micro-SPECT در مطالعه بیماری های قلبی عروقی، سرطان و اختلالات عصبی کاربرد دارد. به عنوان مثال، micro-SPECT می تواند برای مطالعه جریان خون در قلب، ردیابی گسترش سرطان و مطالعه فعالیت مغز استفاده شود.

Micro-CT یا Micro-Computed Tomography یک سیستم تصویربرداری است که تصاویر سه بعدی با وضوح بالا از ساختارهای مختلف ارائه می دهد. این سیستم از اشعه ایکس برای ایجاد تصاویر مقطعی از بدن استفاده می کند که سپس به یک تصویر سه بعدی بازسازی می شود. Micro-CT در مطالعه ساختارهای آناتومیک، تراکم استخوان و مهندسی بافت کاربرد دارد. به عنوان مثال می توان از میکرو سی تی برای مطالعه ساختار و تراکم استخوان، تجزیه و تحلیل ریزمعماری بافت ها و مطالعه رشد تومورها استفاده کرد.

تصویربرداری اپتیکال یا فلورسانس یک تکنیک تصویربرداری غیر تهاجمی است که از نور برای نمایش فرآیندهای بیولوژیکی استفاده می کند. این سیستم از کاوشگرهای فلورسنت برای ردیابی فرآیندهای بیولوژیکی در داخل بدن استفاده می‌کند، که وقتی توسط طول موج خاصی از نور برانگیخته می‌شوند، فوتون های نوری با طول موج متفاوت ساطع می‌کنند. تصویربرداری اپتیکال در مطالعه فرآیندهای سلولی و مولکولی مانند بیان ژن، تعاملات پروتئینی و تحقیقات سرطان کاربرد دارد. به عنوان مثال، تصویربرداری فلورسانس را می توان برای مطالعه توزیع سلول های خاص، ردیابی بیان ژن ها و نظارت بر فعالیت آنزیم ها استفاده کرد.