مرحله نهایی در روش تصویربرداری میکرو‌سی‌تی، انجام اسکن و تجزیه و تحلیل تصاویر است. اسکن شامل گرفتن چندین تصویر بوسیله اشعه ایکس در زوایای مختلف برای تولید تصاویر سه بعدی با وضوح بالا از نمونه است. آنالیز تصویر شامل پردازش تصاویر برای استخراج اطلاعات معنی‌دار، مانند اندازه‌گیری تراکم استخوان، ارزیابی ساختار بافت، و تشخیص تغییرات پاتولوژیک است. متخصصان بسیار ماهر ما از نرم افزارها و تکنیک‌های پیشرفته برای تجزیه و تحلیل دقیق تصاویر و ارائه داده‌های ارزشمند در مورد نمونه مورد مطالعه استفاده می‌کنند. این اطلاعات می‌تواند برای تحقیق و توسعه، کنترل کیفیت و تصمیم‌گیری بالینی استفاده شود.